Metodické pokyny pro ekologické zemědělství

Publikováno: 11. 12. 2025

Aktuálně platné metodické pokyny pro ekologické zemědělství naleznete na stránkách MZe zde.

- ke dni 1. 1. 2026 nabývá účinnosti změna MP č. 2/2024 k registracím - konsolidované znění s vyznačenými změnami připojeno níže.

- ke dni 22. 9. 2025 vešla v platnost revize MP č. 5/2024 ke střídání plodin v EZ - konsolidované znění s vyznačenými změnami připojeno níže.


Metodický pokyn č. 1/2024 (odkaz)
Metodický pokyn upravující podmínky dovozu bioproduktů, konkrétně pak pravidla pro úřední kontroly zásilek bioproduktů, druhy úředních kontrol, kontroly rizikových zásilek, postup při rozdělení zásilek, nedostupnost systému TRACES a notifikace v systému OFIS.


Metodický pokyn č. 2/2024 (odkaz- aktuální konsolidovaná verze ve znění změny ze dne 2.12.2025, změna nabývá účinnosti od 1.1.2026.
Metodický pokyn, kterým se upravují pravidla pro registraci subjektů do ekologického zemědělství a přechodné období, jeho zkracování či prodlužování.

Dochází k následujícím změnám:

  • Rozlišují se typy činností pro registraci do EZ v Registru ekologických podnikatelů a pro certifikaci subjektu dle TRACES.
  • Aktualizuje se seznam pověřených kontrolních organizací v EZ (ukončení pověření kontrolní organizace Bureau Veritas, pověření Certeko CS)
  • Aktualizují se odkazy na příslušné formuláře žádostí a webové stránky (v souvislosti s přechodem domény MZe eagri.cz na jednotnou státní doménu mze.gov.cz).
  • Upřesňují se termíny pro vystavení rozhodnutí o registraci a o zrušení registrace v EZ.
  • Upřesňuje se možnost podání příslušných žádostí elektronickým způsobem.
  • Upřesňuje se ustanovení týkající se registrace do EZ a zahájení přechodného období, a sice, že vstupem do EZ již podnik musí hospodařit v souladu s pravidly nařízení (EU) 2018/848 a souvisejících předpisů.
  • Vkládá se povinnost kontrolních organizací průběžného aktualizování certifikátů v REP.

Metodický pokyn č. 3/2024 (odkaz) - aktuální konsolidovaná verze ve znění změny ze dne 10.1.2025
Metodický pokyn, kterým se upravují pravidla pro udělování výjimek z pravidel ekologické produkce na:

  • vazné ustájení skotu
  • zásahy na zvířatech
  • přivedení konvenčních zvířat na ekologickou farmu
  • použití syntetických vitamínů A, D, E pro přežvýkavce
  • povolení složek potravin zemědělského původu nezískaných z ekologického zemědělství
  • katastrofické události. 

Metodický pokyn č. 4/2024 (odkaz)
Metodický pokyn, kterým se blíže upravují pravidla pro:

  • úřední kontroly a analýza rizik
  • druhy kontrol a množství odebíraných vzorků
  • komunikace mezi Ministerstvem zemědělství, kontrolními organizacemi a státními dozorovými organizacemi
  • kontrolní a certifikační mechanizmy, opatření při zjištění nesouladu majícího vliv na ekologický status produktu
  • přechodná a závěrečná ustanovení

Metodický pokyn č. 5/2024  (odkaz) - aktuální konsolidovaná verze ve znění změny ze dne 22.9.2025
Metodický pokyn, kterým se stanovují pravidla pro střídání plodin na orné půdě, ve sklenících a fóliovnících v ekologickém zemědělství a pro povinné zařazování luskovitých plodin v ekologickém zemědělství - 


Metodický pokyn č. 1/2022  (odkaz)
Metodický pokyn, kterým se stanovují specifická pravidla pro odběr, analýzu a následné vyhodnocení vzorků z ekologického zemědělství. 


Metodický pokyn č. 2/2022 (odkaz)
Pojmy podle přímo použitelných předpisů Evropské unie.


Metodický pokyn č. 3/2022 (odkaz)
Metodický pokyn, kterým se blíže upravují pravidla pro udělování výjimek z pravidel ekologického zemědělství na použití konvenčního osiva a dalšího rozmnožovacího materiálu.


Metodický pokyn č. 2/2021 (odkaz)
Metodický pokyn upravující pravidla pro zakládání a údržbu ovocných sadů, vegetační pokryv sadů, meziřadí vinic a krajinné prvky v režimu ekologického zemědělství.


Metodický pokyn č. 4/2021 (odkaz)
Metodický pokyn, kterým se upravují pravidla pro souběžnou ekologickou a konvenční produkci.


Metodický pokyn č. 7/2021 (odkaz)
Metodický pokyn, kterým se upravují pravidla pro chov koní v režimu ekologického zemědělství.


Metodický pokyn č. 8/2021 (odkaz)
Metodický pokyn, kterým se blíže upravují pravidla pro chov jelenovitých v režimu ekologického zemědělství.


Metodický pokyn č. 1/2018 (odkaz)
Seznam produktů povolených pro účely skladových zásob, čištění a desinfekci v rostlinné ekologické produkci.

Zdroj: MZe